Цель минерализации — разрушить связи, удерживающие полипептиды вместе, и преобразовать их в более простые молекулы (такие как вода, углекислый газ и сульфат аммония). Эти реакции могут быть ускорены за счет температуры, используемой во время разложения по методу Кьельдаля (чем выше используемая температура, тем быстрее может быть проведена минерализация), а также за счет присутствия кислот, солей и катализаторов (селен, медь, титан). Пары, выходящие из трубок, удаляются вакуумным насосом JP который рециркулирует воду и удаляются в скруббере SMS. Эта конфигурация оптимизирует эффективность работы. Избегайте использования установок для минерализации по методу Кьельдаля без вытяжных систем: это значительно сократит срок их службы и может привести к серьезному ущербу. Это самый трудоемкий этап анализа.