La méthode Kjeldahl ne mesure pas, ou mesure partiellement, certains composés azotés tels que les azides, les azocompounds, les hydrazones, l'hydrazine et l'hydroxylamine, les nitrites et les nitrates.
L'azote total, quant à lui, est la somme de l'azote nitrique (NO3-N), de l'azote nitrique (NO2-N), de l'azote ammoniacal (NH3-N) et des structures d'azote organique lié : il est déterminé dans les échantillons dans lesquels la présence d'azote inorganique est significative.
La connaissance de la composition et des composés de l'azote est essentielle pour les stations de traitement de l'eau et des eaux usées, où l'azote organique est transformé en azote inorganique. Pour déterminer l'azote total dans le sol et les boues des stations d'épuration des eaux usées agricoles, il est nécessaire d'additionner les valeurs de l'ammoniac, des nitrites, des nitrates, de l'urée et de l'azote organique.
Dans ces cas, la méthode de combustion de Dumas est une alternative valable à l'analyse Kjeldahl, car elle offre des résultats plus précis et généralement légèrement supérieurs.